MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Allochromatium vinosum DSM 180 chromosome

Total Repeats: 75679

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_013851	GTG	2	6	149584	149589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288939903
3002	NC_013851	CAG	2	6	149644	149649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939903
3003	NC_013851	GCC	2	6	149656	149661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939903
3004	NC_013851	GC	3	6	149663	149668	0 %	0 %	50 %	50 %	288939903
3005	NC_013851	GGC	2	6	149674	149679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939903
3006	NC_013851	CCA	2	6	149774	149779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288939903
3007	NC_013851	TGATC	2	10	149928	149937	20 %	40 %	20 %	20 %	288939903
3008	NC_013851	CAG	2	6	149947	149952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939903
3009	NC_013851	GACCG	2	10	149982	149991	20 %	0 %	40 %	40 %	288939903
3010	NC_013851	ACGG	2	8	150017	150024	25 %	0 %	50 %	25 %	288939903
3011	NC_013851	AGCC	2	8	150052	150059	25 %	0 %	25 %	50 %	288939903
3012	NC_013851	TGC	2	6	150086	150091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939903
3013	NC_013851	AAG	2	6	150228	150233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288939904
3014	NC_013851	TGA	2	6	150271	150276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288939904
3015	NC_013851	GC	3	6	150285	150290	0 %	0 %	50 %	50 %	288939904
3016	NC_013851	ACG	2	6	150381	150386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939904
3017	NC_013851	CGA	2	6	150389	150394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939904
3018	NC_013851	CTG	2	6	150396	150401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939904
3019	NC_013851	TCG	2	6	150472	150477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939904
3020	NC_013851	TGG	2	6	150538	150543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288939904
3021	NC_013851	GGC	2	6	150551	150556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939904
3022	NC_013851	CGT	2	6	150590	150595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939904
3023	NC_013851	GGC	2	6	150640	150645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939904
3024	NC_013851	TCA	2	6	150676	150681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939904
3025	NC_013851	CCT	2	6	150712	150717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288939904
3026	NC_013851	CAA	2	6	150821	150826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288939904
3027	NC_013851	ACA	2	6	150853	150858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288939904
3028	NC_013851	AGC	2	6	150874	150879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939904
3029	NC_013851	TCG	2	6	150907	150912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939904
3030	NC_013851	CGA	2	6	150935	150940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939904
3031	NC_013851	GC	3	6	150942	150947	0 %	0 %	50 %	50 %	288939904
3032	NC_013851	CGC	2	6	150949	150954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939904
3033	NC_013851	TCA	2	6	150955	150960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939904
3034	NC_013851	GCA	2	6	150979	150984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939904
3035	NC_013851	CGGGC	2	10	151070	151079	0 %	0 %	60 %	40 %	288939904
3036	NC_013851	CGA	2	6	151091	151096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939904
3037	NC_013851	GAA	2	6	151122	151127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288939904
3038	NC_013851	TCG	2	6	151153	151158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939904
3039	NC_013851	CTG	2	6	151167	151172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939904
3040	NC_013851	GCC	2	6	151230	151235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939904
3041	NC_013851	GC	3	6	151238	151243	0 %	0 %	50 %	50 %	288939904
3042	NC_013851	AGA	2	6	151258	151263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288939904
3043	NC_013851	GGTCA	2	10	151287	151296	20 %	20 %	40 %	20 %	288939904
3044	NC_013851	TCG	2	6	151300	151305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939904
3045	NC_013851	AAGG	2	8	151374	151381	50 %	0 %	50 %	0 %	288939904
3046	NC_013851	CGG	2	6	151474	151479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939904
3047	NC_013851	CAG	2	6	151500	151505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939904
3048	NC_013851	GTC	3	9	151521	151529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939904
3049	NC_013851	ACCA	2	8	151536	151543	50 %	0 %	0 %	50 %	288939904
3050	NC_013851	CGA	2	6	151556	151561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939904
3051	NC_013851	ATC	2	6	151608	151613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939904
3052	NC_013851	TCGA	2	8	151668	151675	25 %	25 %	25 %	25 %	288939904
3053	NC_013851	AAG	2	6	151704	151709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288939904
3054	NC_013851	AGC	2	6	151741	151746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939904
3055	NC_013851	CAT	2	6	151763	151768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939904
3056	NC_013851	CCA	2	6	151804	151809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288939904
3057	NC_013851	CGG	2	6	151841	151846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939904
3058	NC_013851	GC	3	6	151901	151906	0 %	0 %	50 %	50 %	288939904
3059	NC_013851	CGG	2	6	151943	151948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939904
3060	NC_013851	CTC	2	6	152036	152041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288939904
3061	NC_013851	GAT	2	6	152105	152110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288939904
3062	NC_013851	AGC	2	6	152218	152223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939904
3063	NC_013851	ACG	2	6	152233	152238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939904
3064	NC_013851	GATG	2	8	152288	152295	25 %	25 %	50 %	0 %	288939904
3065	NC_013851	GC	3	6	152327	152332	0 %	0 %	50 %	50 %	288939904
3066	NC_013851	GGA	2	6	152381	152386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288939904
3067	NC_013851	TCG	2	6	152419	152424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939904
3068	NC_013851	CGG	2	6	152432	152437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939904
3069	NC_013851	GAG	2	6	152484	152489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288939904
3070	NC_013851	GCC	2	6	152497	152502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939904
3071	NC_013851	GC	3	6	152579	152584	0 %	0 %	50 %	50 %	288939904
3072	NC_013851	ACC	2	6	152620	152625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288939904
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3074	NC_013851	GAC	2	6	152759	152764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939904
3075	NC_013851	GAG	2	6	152889	152894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288939904
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3077	NC_013851	CCCTGT	2	12	152982	152993	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	288939904
3078	NC_013851	TGC	2	6	153018	153023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939904
3079	NC_013851	GCGT	2	8	153097	153104	0 %	25 %	50 %	25 %	288939905
3080	NC_013851	CGA	2	6	153143	153148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939905
3081	NC_013851	CGA	2	6	153178	153183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939905
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3083	NC_013851	TGC	2	6	153215	153220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939905
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3085	NC_013851	CCGCG	2	10	153256	153265	0 %	0 %	40 %	60 %	288939905
3086	NC_013851	GC	4	8	153307	153314	0 %	0 %	50 %	50 %	288939905
3087	NC_013851	CGA	2	6	153320	153325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939905
3088	NC_013851	CG	3	6	153328	153333	0 %	0 %	50 %	50 %	288939905
3089	NC_013851	CTG	2	6	153335	153340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939905
3090	NC_013851	CGC	2	6	153341	153346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939905
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3092	NC_013851	GAG	2	6	153375	153380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288939905
3093	NC_013851	CG	3	6	153425	153430	0 %	0 %	50 %	50 %	288939905
3094	NC_013851	GCC	2	6	153438	153443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939905
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3096	NC_013851	GC	4	8	153492	153499	0 %	0 %	50 %	50 %	288939905
3097	NC_013851	CAT	2	6	153500	153505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939905
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3100	NC_013851	GGC	3	9	153683	153691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939905
3101	NC_013851	TCG	2	6	153787	153792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939905
3102	NC_013851	GCG	2	6	153825	153830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939905
3103	NC_013851	GC	3	6	153918	153923	0 %	0 %	50 %	50 %	288939905
3104	NC_013851	CGA	2	6	153929	153934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939905
3105	NC_013851	CGC	2	6	153967	153972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939905
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3107	NC_013851	GGGC	2	8	154032	154039	0 %	0 %	75 %	25 %	288939905
3108	NC_013851	TCG	2	6	154096	154101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939905
3109	NC_013851	GCGG	2	8	154104	154111	0 %	0 %	75 %	25 %	288939905
3110	NC_013851	CG	3	6	154113	154118	0 %	0 %	50 %	50 %	288939905
3111	NC_013851	GCT	2	6	154143	154148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939905
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3115	NC_013851	GC	3	6	154513	154518	0 %	0 %	50 %	50 %	288939906
3116	NC_013851	TCA	2	6	154540	154545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939906
3117	NC_013851	GAC	2	6	154589	154594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939906
3118	NC_013851	CTGG	2	8	154636	154643	0 %	25 %	50 %	25 %	288939906
3119	NC_013851	GAG	2	6	154649	154654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288939906
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3121	NC_013851	CGC	2	6	154675	154680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939906
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3243	NC_013851	ACG	2	6	161035	161040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939913
3244	NC_013851	GGC	2	6	161089	161094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939913
3245	NC_013851	CTCGAC	2	12	161106	161117	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	288939913
3246	NC_013851	GCT	2	6	161216	161221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939913
3247	NC_013851	CGAG	2	8	161252	161259	25 %	0 %	50 %	25 %	288939913
3248	NC_013851	CGGC	2	8	161264	161271	0 %	0 %	50 %	50 %	288939913
3249	NC_013851	CGC	2	6	161307	161312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939913
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3256	NC_013851	GC	3	6	161580	161585	0 %	0 %	50 %	50 %	288939913
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3265	NC_013851	GCG	2	6	162074	162079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939914
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3485	NC_013851	GCG	3	9	171698	171706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939924
3486	NC_013851	TGAT	2	8	171740	171747	25 %	50 %	25 %	0 %	288939924
3487	NC_013851	CGGT	2	8	171852	171859	0 %	25 %	50 %	25 %	288939924
3488	NC_013851	GTT	2	6	171907	171912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288939924
3489	NC_013851	GCA	2	6	171978	171983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939924
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3493	NC_013851	GCA	2	6	172170	172175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939924
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